Biostatistik, 6 hp
Biostatistics, 6 credits- Kurskod
- 4BI101
- Kursens benämning
- Biostatistik
- Hp
- 6 hp
- Utbildningsform
- Högskoleutbildning, 2007 års studieordning
- Huvudområde
- Biomedicin
- Nivå
- AV - Avancerad nivå
- Betygsskala
- Väl godkänd, godkänd, underkänd
- Kursansvarig institution
- Institutet för miljömedicin
- Beslutande organ
- Programnämnd 7
- Datum för fastställande
- 2016-10-17
- Reviderad av
- Programnämnden för biomedicinprogrammen
- Senast reviderad
- 2018-10-30
- Kursplanen gäller från
- Vårterminen 2019
Särskild behörighet
Kandidat- eller yrkesexamen om minst 180 hp inom biomedicin, bioteknik, cell- och molekylärbiologi, medicin eller motsvarande examen. Dessutom krävs Engelska B/Engelska 6 med lägst betyget godkänd/E.
Mål
Kursens syfte är att ge studenterna kännedom om statistiska begrepp samt verktyg för att relatera biologiska utfall med möjliga förklarande variabler.
Kursen fokuserar i huvudsak på regressionsmodeller. I slutet av kursen förväntas studenterna självständigt kunna analysera ett verkligt datamaterial genom att tillämpa en passande regressionsmodell, identifiera olika kovariaters roll samt använda olika metoder för att hantera ickelinjäritet och interaktionseffekter.
Efter genomgången kurs ska studenten kunna:
Avseende kunskap och förståelse
- förklara konceptet slumpmässig variation i biologiska företeelser samt beskriva hur den är relaterad till vetenskapliga observationsstudier och experimentella studier,
- beskriva vilka statistiska metoder som är lämpliga för att kvantifiera slumpmässiga och systematiska effekter i biologiska data,
- diskutera skillnaden mellan förklarande och prediktiva modeller.
Avseende färdighet och förmåga
- välja och anpassa multivariata regressionsmodeller av medelhög komplexitet genom att använda ett allmänt erkänt dataprogram,
- förmedla statistiska resultat på ett sätt som lämpar sig för muntlig presentation, teknisk rapportering och vetenskaplig publicering,
- förstå, diskutera och kritiskt utvärdera statistiska fynd av medelhög komplexitet i relevant vetenskaplig litteratur.
Avseende värderingsförmåga och förhållningssätt
- uppvisa förmåga att väga ihop motstridiga empiriska bevis från litteraturen.
Innehåll
Slumpmässighet i biologiska observationer. Data från experiment och observationsstudier. Datatyper: nominala, ordinala och kontinuerliga variabler. Deskriptiva mått. Grafisk presentation. Sannolikhetsbegrepp. Sannolikhetsfördelningar. Parameterskattning: medelvärde, andel, kvot, standardavvikelse, standardfel. Begrepp inom statistisk inferens: konfidensintervall och hypotesprövning. Elementära parametriska hypotestest. Enkel linjär regression.
Multipel linjär regression. Linjära modeller. Kontinuerliga och kategoriska prediktorer. Kovarianters roll. Samspel (interaktioner). Ickelinjär effekt på kovarianter. Modellanpassning och diagnostik. Generaliserade linjära modeller och logistisk regression. Överlevnadsanalys och Cox regressionsmodell.
Kvantilregression. Metoder för longitudinella data.
Arbetsformer
Undervisningen innefattar föreläsningar och praktiska datorövningar.
Examination
Examinationen består av skriftlig tentamen.
Begränsning av antal prov- eller praktiktillfällen
De studenter som ej är godkända efter ordinarie provtillfälle har rätt att delta vid ytterligare fem provtillfällen. Om studenten genomfört sex underkända tentamina/prov ges inte något ytterligare tentamenstillfälle eller någon ny kursplats.
Som provtillfälle räknas de gånger studenten deltagit i ett och samma prov. Inlämning av blank skrivning räknas som provtillfälle. Provtillfälle till vilket studenten anmält sig med inte deltagit räknas inte som provtillfälle.
Övergångsbestämmelser
Efter varje kurstillfälle kommer det att erbjudas minst sex tillfällen för examination inom en 2-årsperiod efter kursens slut.
Övriga föreskrifter
Kursen ges på engelska.
Kursutvärdering kommer att genomföras enligt de riktlinjer som är fastställda av Styrelsen för utbildning.
Muntlig utvärdering, kursråd, kommer att genomföras under kursen.
Litteratur och övriga läromedel
Rekommenderad litteratur
London : Chapman and Hall, 1991 - xii, 611 s. ISBN:0-412-38620-8 (hft.) LIBRIS-ID:8286190 Sök i biblioteket
3. ed., [Nachdr.] : Oxford : Oxford University Press, 2009 - XVI, 405 S ISBN:978-0-19-263269-2 LIBRIS-ID:11926588 Sök i biblioteket
2. ed. : New York : Springer, cop. 2008 - xvi, 363 s. ISBN:978-0-387-79053-4 (pbk. : alk. paper) LIBRIS-ID:11305121 Sök i biblioteket
2. ed. : Pacific Grove : Duxbury, cop. 2000 - xvi, 525 s. , [42] s. ISBN:0-534-22902-6 ; No price LIBRIS-ID:5036554 Sök i biblioteket
6. ed. : Belmont, Calif. : Thomson/Brooks/Cole, cop. 2006 - xx, 868 p. ISBN:0534418201 LIBRIS-ID:9942420 Sök i biblioteket