Tillämpad biostatistik, 7,5 hp
Applied biostatistics, 7,5 credits- Kurskod
- 4BI108
- Kursens benämning
- Tillämpad biostatistik
- Hp
- 7,5 hp
- Utbildningsform
- Högskoleutbildning, 2007 års studieordning
- Huvudområde
- Biomedicin
- Nivå
- AV - Avancerad nivå
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (G) eller väl godkänd (VG)
- Kursansvarig institution
- Institutet för miljömedicin
- Beslutande organ
- Programnämnden för biomedicinprogrammen
- Datum för fastställande
- 2021-02-25
- Kursplanen gäller från
- Höstterminen 2021
Särskild behörighet
Kandidat- eller yrkesexamen om minst 180 hp inom biomedicin, bioteknik, cell- och molekylärbiologi, medicin eller motsvarande examen. Dessutom krävs Engelska B/Engelska 6 med lägst betyget godkänd/E.
Mål
Kursen syfte är att ge studenterna kännedom om statistiska begrepp samt verktyg för att relatera biologiska utfall till möjliga förklarande variabler.
Kursen fokuserar i huvudsak på regressionsmodellering.
Efter genomgången kurs ska studenten kunna:
Avseende kunskap och förståelse
- förklara konceptet slumpmässig variation i biologiska företeelser samt beskriva hur den är relaterad till vetenskapliga observationsstudier och experimentella studier,
- beskriva vilka statistiska metoder som är lämpliga för att kvantifiera slumpmässiga och systematiska effekter i komplexa biologiska data,
- diskutera skillnaden mellan förklarande och prediktiv modellering.
Avseende färdighet och förmåga
- välja och anpassa multivariata regressionsmodeller av medelhög komplexitet genom att använda ett standard statistikprogram,
- kommunicera statistiska resultat på ett sätt som lämpar sig för muntlig presentation och vetenskaplig publicering.
Avseende värderingsförmåga och förhållningssätt
- utvärdera och integrera empiriska bevis i förhållande till biostatistiska problem och biostatistik-litteraturen
- överväga de etiska dimensionerna i statistisk analys och hur resultaten rapporteras
Innehåll
Slumpmässighet i biologiska observationer. Data från experiment och observationsstudier. Datatyper: nominala, ordinala och kontinuerliga variabler. Deskriptiva mått. Grafisk presentation. Sannolikhetsbegrepp. Sannolikhetsfördelningar. Parameterskattning: medelvärde, andel, kvot, standardavvikelse, standardfel. Begrepp inom statistisk inferens: konfidensintervall och hypotesprövning. Elementära parametriska hypotestest. Enkel linjär regression. Multipel linjär regression. Linjära modeller. Kontinuerliga och kategoriska prediktorer. Kovarianters roll. Samspel (interaktioner). Ickelinjär effekt på kovarianter. Modellanpassning och diagnostik. Generaliserade linjära modeller och logistisk regression. Överlevnadsanalys och Cox regressionsmodell. Kvantilregression. Metoder för longitudinella data.
Arbetsformer
Undervisningen innefattar föreläsningar och praktiska datorövningar.
Examination
Examinationen består av skriftlig tentamen. Betygssätts U/G/VG.
Begränsning av antal prov- eller praktiktillfällen
De studenter som ej är godkända efter ordinarie provtillfälle har rätt att delta vid ytterligare fem provtillfällen. Om studenten genomfört sex underkända tentamina/prov ges inte något ytterligare tentamenstillfälle eller någon ny kursplats.
Som provtillfälle räknas de gånger studenten deltagit i ett och samma prov. Inlämning av blank skrivning räknas som provtillfälle. Provtillfälle till vilket studenten anmält sig med inte deltagit räknas inte som provtillfälle.
Examinator bedömer om och i så fall hur frånvaro från obligatoriska utbildningsinslag kan tas igen. Innan studenten deltagit i de obligatoriska utbildningsinslagen eller tagit igen frånvaro i enlighet med examinators anvisningar kan inte studieresultaten slutrapporteras. Frånvaro från ett obligatoriskt utbildningsinslag kan innebära att den studerande inte kan ta igen tillfället förrän nästa gång kursen ges.
Om det föreligger särskilda skäl, eller behov av anpassning för student med funktionsnedsättning, får examinator fatta beslut om att frångå kursplanens föreskrifter om examinationsform, antal examinationstillfällen, möjlighet till komplettering eller undantag från obligatoriska utbildningsmoment, m.m. Innehåll och lärandemål samt nivån på förväntade färdigheter, kunskaper och förmågor får inte ändras, tas bort eller sänkas.
Övriga föreskrifter
Kursen ges på engelska och examinationen är på engelska.
Kursutvärdering kommer att genomföras enligt de riktlinjer som är fastställda av Kommittén för utbildning.
Muntlig utvärdering, kursråd, kommer att genomföras under kursen.
Litteratur och övriga läromedel
Rekommenderad litteratur
London : Chapman and Hall, 1991 - xii, 611 s. ISBN:0-412-38620-8 (hft.) LIBRIS-ID:8286190 Sök i biblioteket
3. ed., [Nachdr.] : Oxford : Oxford University Press, 2009 - XVI, 405 S ISBN:978-0-19-263269-2 LIBRIS-ID:11926588 Sök i biblioteket
2. ed. : New York : Springer, cop. 2008 - xvi, 363 s. ISBN:978-0-387-79053-4 (pbk. : alk. paper) LIBRIS-ID:11305121 Sök i biblioteket
2. ed. : Pacific Grove : Duxbury, cop. 2000 - xvi, 525 s. , [42] s. ISBN:0-534-22902-6 ; No price LIBRIS-ID:5036554 Sök i biblioteket
6. ed. : Belmont, Calif. : Thomson/Brooks/Cole, cop. 2006 - xx, 868 p. ISBN:0534418201 LIBRIS-ID:9942420 Sök i biblioteket