Kursplan för Biostatistik

Biostatistics

Särskild behörighet

Lägst betyget G på kurserna Introduktion till biomedicin, Allmän och organisk kemi, Cell-, stamcells- och utvecklingsbiologi, och Genetik, genomik och funktionell genomik, samt lägst betyget G på momentet Metabolism i hälsa och sjukdom (3 hp) på kursen Biokemi, på Kandidatprogrammet i biomedicin.

Mål

Kursens syfte är att ge studenterna kännedom om basala statistiska begrepp och verktyg som kan användas för att tolka resultat publicerade i vetenskaplig litteratur och för att genomföra egna statistiska analyser.

Efter genomgången kurs ska studenten kunna:

Avseende kunskap och förståelse
* förklara konceptet slumpmässig variation i biologiska företeelser samt hur det är relaterat till observationsstudier och experimentella studier,
* beskriva lämpliga statistiska metoder för att kvantifiera slumpmässiga och systematiska effekter i biologiska data,
* diskutera (på en elementär nivå) relevansen av statistisk inferens för empirisk forskning.

Avseende färdighet och förmåga
* välja och tillämpa statistiska metoder för frågeställningar inom forskning med hjälp av dataprogram i statistisk,
* förmedla statistiska resultat för muntliga presentationer och vetenskapliga publiceringar,
* tolka och diskutera statistiska fynd av basal komplexitet i relevant vetenskaplig litteratur.

Avseende värderingsförmåga och förhållningssätt
* bedöma vetenskapliga hypoteser baserat på empiriska bevis.

Innehåll

Datatyper: nominala, ordinala och kontinuerliga variabler. Deskriptiva mått. Grafisk presentation. Slumpmässighet i biologiska observationer. Statistiskt tänkande kring slumpmässighet. Data från experiment och observationsstudier. Sannolikhetsbegrepp. Sannolikhetsfördelningar: coin, dice, Poisson, Binomial, Exponential, Normal, Student's t. Parameterskattning: medelvärde och proportion. Kvantifiering av statistisk osäkerhet: standardfel, konfidensintervall och hypotesprövningar. Elementära hypotestest: Z-test, t-test. Elementära överväganden avseende power och stickprovsstorlek.

Korrelation och enkel linjär regression. Statistiska modeller. Verifiering och mildrande av modellantaganden. Robusta (icke-parametriska och fördelningsfria) metoder. Analys av kontingenstabeller.

Arbetsformer

Undervisningen innefattar föreläsningar och praktiska datorövningar.

Examination

Examinationen består av skriftlig tentamen.

Obligatoriskt deltagande
Examinator bedömer om och i så fall hur frånvaro från obligatoriska utbildningsinslag kan kompenseras för. Studenten måste delta i de obligatoriska utbildningsinslagen eller ta igen frånvaro i enlighet med examinators anvisningar för att klara kursen. Frånvaro från ett obligatoriskt utbildningsinslag kan innebära att den studerande inte kan göra detta utbildningsinslag förrän nästa gång kursen ges.

Begränsning av antal provtillfällen
Student som ej är godkänd efter första examinationstillfället har rätt att delta vid ytterligare fem examinationstillfällen. Om studenten inte är godkänd efter fyra examinationstillfällen, rekommenderas han/hon att ta kursen nästa ordinarie kurstillfälle och kan, efter det, delta i två ytterligare examinationstillfällen. Om studenten genomfört sex underkända tentamina/prov ges inte något ytterligare examinationstillfälle.

Som provtillfälle räknas när studenten fysiskt närvarat eller på annat sätt deltagit vid en examination. Inlämning av icke ifylld examinationsuppgift som provtillfälle. Provtillfälle till vilket studenten anmält sig men inte deltagit räknas inte som ett provtillfälle.

Anpassning av examination
Om det föreligger särskilda skäl, eller behov av anpassning för student med funktionsnedsättning, får examinator fatta beslut om att frångå kursplanens föreskrifter om examinationsform, antal examinationstillfällen, möjlighet till komplettering eller undantag från obligatoriska utbildningsmoment, m.m. Innehåll och lärandemål samt nivån på förväntade färdigheter, kunskaper och förmågor får inte ändras, tas bort eller sänkas.

Övriga föreskrifter

Kursen ges på engelska.

Kursutvärdering kommer att genomföras enligt de riktlinjer som är fastställda av Styrelsen för utbildning.

Muntlig utvärdering, kursråd, kommer att genomföras under kursen.

Litteraturlista och övriga läromedel

Rekommenderad litteratur

• Altman, Douglas G., Practical statistics for medical research, London : Chapman and Hall, 1991 - xii, 611 s. ISBN: 0-412-38620-8 (hft.), LIBRIS-ID: 8286190,
• Bland, Martin, An introduction to medical statistics, 3. ed., [Nachdr.] : Oxford : Oxford University Press, 2009 - XVI, 405 S ISBN: 978-0-19-263269-2, LIBRIS-ID: 11926588,
• Dalgaard, Peter, Introductory statistics with R, 2. ed. : New York : Springer, cop. 2008 - xvi, 363 s. ISBN: 978-0-387-79053-4 (pbk. : alk. paper), LIBRIS-ID: 11305121,
• Pagano, Marcello; Gauvreau, Kimberlee, Principles of biostatistics, 2. ed. : Pacific Grove : Duxbury, cop. 2000 - xvi, 525 s. , [42] s. ISBN: 0-534-22902-6 ; No price, LIBRIS-ID: 5036554,
• Rosner, Bernard, Fundamentals of biostatistics, 6. ed. : Belmont, Calif. : Thomson/Brooks/Cole, cop. 2006 - xx, 868 p. ISBN: 0534418201, LIBRIS-ID: 9942420,