Kursplan för Bioinformatik, uppdragsutbildning

Bioinformatics, Contract Education

Särskild behörighet

Kandidat- eller yrkesexamen om minst 180 högskolepoäng inom biomedicin, bioteknik, cell- och molekylärbiologi eller medicin.

Mål

Efter genomgången kurs skall studenten kunna: • förklara och beskriva teorier och metoder som används inom bioinformatiken, • redogöra för hur bioinformatiska metoder används inom biomedicinsk forskning, • använda olika bioinformatiska tekniker, • analysera bioinformatiska data, • kritiskt bedöma och utvärdera vilka metoder som bör användas för att lösa specifika bioinformatiska frågeställningar.

Innehåll

Kursen behandlar både sekvensrelaterad och icke sekvensrelaterad bioinformatik innefattande databaser och hantering av sekvensdata, parvis jämförelser, multipla jämförelser och fylogeni. Vidare behandlas: • bioinformatikportaler och olika sökmotorer, • mönster och motiv för DNA och proteiner, • profilsökning och strukturförutsägelser, • molekylmodellering med liganddockningar, • enzymdatabaser samt hantering av microarray- och genontologidata, En kort bakgrund ges till de algoritmer som används i de olika programmen.

Arbetsformer

Undervisningen innefattar föreläsningar, demonstrationer samt grupp- och dataövningar med inlämningsuppgifter. Data-analyserna kommer att utföras med webbaserade program.

Examination

Kursen examineras genom en skriftlig tentamen. Obligatorisk närvaro Ingen obligatorisk närvaro, men alla arbets- och inlämningsuppgifter måste vara godkända. Närvaro på föreläsningar och övningar rekommenderas starkt. Begränsning av antal prov- eller praktiktillfällen De studenter som inte är godkända efter ordinarie provtillfälle har rätt att delta vid ytterligare fem provtillfällen. Om den studerande inte är godkänd efter fyra provtillfällen rekommenderas denna att gå om kursen vid nästa ordinarie kurstillfälle, och får därefter delta vid ytterligare två provtillfällen. Om studenten genomfört sex underkända tentamina/prov ges inte något ytterligare tentamenstillfälle eller någon ny kursplats. Som provtillfälle räknas de gånger studenten deltagit i ett och samma prov. Inlämning av blank skrivning räknas som provtillfälle. Provtillfälle till vilket studenten anmält sig med inte deltagit räknas inte som provtillfälle.

Övergångsbestämmelser

Efter varje kurstillfälle kommer det att erbjudas minst sex tillfällen för examination inom en 2-årsperiod efter kursens slut.

Övriga föreskrifter

Undervisningen sker på engelska. Kursutvärdering kommer att genomföras enligt de riktlinjer som är fastställda av Styrelsen för utbildning.