För studenter på kursen Next-generation sequencing (NGS) och bioinformatik (7,5 hp) kurskod 3BL008
Samläses med inriktning avancerad patologi. Kursens syfte är att studenten ska få kunskap om teorin bakom de nya sekvenseringsmetoderna, next-generation sequencing (NGS) och massiv parallell sekvensering, samt bioinformatisk analys av sekvenseringsdata inom genomik och transkriptomik.
Kursplan
Kursinformation
Kursen kommer ge fördjupad kunskap inom avancerade analysmetoder baserade på NGS, samt hur dessa kan användas inom diagnostik och forskning. Kursen innefattar även bioinformatisk analys av NGS-data som är av relevans för biomedicinska analytiker.
Välkomstinformation
Välkommen till Next-generation sequencing (NGS) och bioinformatik kurs!
Kursen börjar måndagen den 2:a september online. Se till att din KI inloggning fungerar och att du har tillgång till kursrum i Canvas.
Schema
Kursen är uppdelad i fem delar:
Introduktionen till NGS teknologi (v. 36); Genomik (v. 37-39); Transkriptomik analys med användning av R (v.40-41); Användning och analys av stora data i kliniken och forskningslabb (v. 42-43) och Självarbete/ förbederelse inför tenta (v. 44).
Varje fredag kl. 9-12 hålls seminarium på Zoom med obligatoriskt deltagande.
Muntlig redovisning av projektarbete sker på Zoom.
Skriftlig examination sker på plats.
Kursanalys och kursvärdering
KI:s elektroniska kursutvärdering skickas ut efter kursens slut. Kursanalys samt resultat av kursvärdering kommer att finnas tillgängliga här, på kurswebben och i kursrummet i Canvas.